El gobierno, administración y representación del Grupo de Universidades Iberoamericanas La Rábida se articula a través de órganos colegiados y unipersonales.
- Son órganos colegiados: la Asamblea General y el Comité Ejecutivo.
- Son órganos unipersonales:
- la Presidencia Ejecutiva,
- la Dirección Ejecutiva,
- la Vicepresidencia Primera,
- la Vicepresidencia Segunda,
- y la Vicepresidencia Regional.
Toda representación dentro del Grupo tiene carácter institucional y honorífico.